En el s. XII la dinastía de Zähringer adquiría la región y la nombraron margraviato Baden. Baden-Baden recibió privilegios de ciudad en 1250.

Durante la guerra de Sucesión del Palatinado (1688-1697) la ciudad fue encendida por las tropas francesas y en consecuencia de este acontecimiento el margrave Luis Guillermo de Baden nació 1655 en Paris, conocido como Luis el Turco, trasladó en 1705 su sede residencial a su nuevo palacio construido en Rastatt y se acabó el servicio balneario. La ciudad de Baden-Baden continuó como sede administrativa.

A finales del s. XVIII se reactivó el balneario para los huéspedes del congreso de Rastatt. Se construyeron hoteles de lujo, la casa de curas (1821–1824), el pabellón de la fuente (1839–1842) y el casino. Desde 1858 se celebran internacionales carreras de caballos en el hipódromo de Iffezheim. De Baden-Baden a Freudenstadt transcurre la Gran ruta de la Selva Negra (Ruta de las Cumbres).

En la Stiftskirche, que sobrevivió al fuego de 1689, se conserva un crucifijo de piedra arenisca, obra maestra de Nikolaus von Leyden de 1467 y los mausoleos de los margraves de Baden. Entre estos destaca el epitafio del margrave Luis Guillermo (Türkenlouis), en forma de un altar barroco. El margrave participó en aprox. 57 batallas, combates y sitios pero jamás fue vencido. Falleció en el año 1707 por una herida, sufrida en el combate al Schellenberg.

Cerca de la iglesia se halla el histórico Friedrichsbad de 1877 (Neorenaissance), en donde se puede disfrutar de la cultura balnearia de estilo romano-irlandés. En el norte del complejo se eleva el Neue Schloss, construido en el s. XV por orden del margrave Christoph I. En la guerra de Sucesión del Palatinado el palacio sufrió grandes daños. El gran duque Leopold mandó a reedificarlo en el s. XIX y a continuación fue residencia de verano de los Grandes Duques de Baden hasta 1918.

En la Lichtentaler Allee comienza la zona balnearia con la Kurhaus y la Trinkhalle (Pabellón de fuente) de una longitud de 90 metros.16 columnas corintias portan las arcadas, que están decoradas con 14 pinturas murales, representando escenas de leyendas de la región de Baden-Baden. Pasando por la galería Kunsthalle, el jardín de Rosas en la Gönneranlage y el jardín balneario, el paseo Lichtentaler finaliza en la antigua abadía cisterciense de Lichtental, fundada en 1245. 500 metros más adelante está la casa de Brahms, donde vivió el famoso compositor desde 1865 hasta 1874.

Desde el Merkur se puede disfrutar de una vista panorámica sobre la ciudad de Baden-Baden y del valle del río Rin. Para subir a la colina se puede hacer uso del funicular.